Um comando para listar pelo terminal, o encoding dos arquivos de determinada pasta.

Mac-mini:lw_html5 william$ for file in *.php; do file --mime $file; done
404.php: text/x-php; charset=us-ascii
archive.php: text/x-php; charset=utf-8
comments.php: text/x-php; charset=us-ascii
footer.php: text/plain; charset=us-ascii
functions.php: text/x-php; charset=us-ascii
header.php: text/html; charset=us-ascii
index.php: text/x-php; charset=utf-8
page.php: text/x-php; charset=utf-8
search.php: text/x-php; charset=utf-8
searchform.php: text/plain; charset=us-ascii
sidebar.php: text/plain; charset=us-ascii
single.php: text/x-php; charset=utf-8

É isso.

=)